本发明提供了一种基于混合网格的隧道电阻率建模方法及系统,确定需要进行建模隧道的物理尺寸、实际形状、供电和采集电极位置及可能出现的不良地质区域;根据隧道实际形状和尺寸建立有限元几何模型;对有限单元几何模型进行网格剖分,对供电、采集电极位置及可能出现的不良地质区域进行非结构四面体网格局部加密剖分,其它均匀围岩介质采用非规则六面体进行网格剖分,形成优化后的模型;对优化后的模型各单元的质量参数进行检查,对单元形状进行迭代优化,使得不同尺寸和不同类型单元之间过渡均匀,直至所有单元满足质量要求,本发明可以较好地拟合复杂结构型式,大程度降低了模型离散化误差和提高实际隧道复杂环境电阻率法的正演精度。