本发明公开了一种燃料电池汽车电机驱动容错控制系统及方法,该系统包括变流器、电流模块、变量计算模块、功率预测模块、转速模块、通讯模块、预测功率控制、恒压频比控制及脉冲宽度调制。所述电流模块包括电流测量模块、电流观测方法、电流判断模块及电流选择模块。所述转速模块包括转速测量模块、转速观测模块、转速判断模块及转速选择模块。还公开了该系统的控制方法,本发明采用基于上述系统的一种燃料电池汽车电机驱动容错控制方法及系统,可以实现快速的传感器故障诊断与定位,保证电机驱动系统安全稳定运行,引入预测功率控制,提高了电机驱动系统的动态响应速度和设计灵活性。