本发明涉及一种药品数据多方匹配方法、装置和存储介质,实现保护药品匹配各方隐私。本发明药品清单所有方利用混淆药品清单构建零知识证明风格的药品存在性证明多项式,药品数据流转的各方基于药品存在性证明多项式构建药品存在隐私秘密比较;药品清单所有方利用混淆药品清单构建零知识证明风格的药品规格合规性证明多项式,药品数据流转的各方基于药品规格合规性证明多项式构建药品规格隐私秘密比较;药品清单所有方利用混淆药品清单中的任意药品数据组合构建相应的药品需求矩阵,基于药品需求矩阵构建药品数据证明多项式组,药品数据流转的各方基于药品数据证明多项式组构建零知识证明风格的药品数据隐私秘密比较,药品库存匹配和处方询价。