本发明公开了一种富水地层单层衬砌水压力计算方法及系统,包括:确定隧道断面所在水压分布状况;确定隧道所在水头高度和渗透系数;确定隧道各结构初期支护外径、防水层外径、二次衬砌内径、二次衬砌外径;确定隧道各结构渗透系数和水头高度;针对单层衬砌结构特点进行渗流连续方程公式推导,进行拉普拉斯坐标化简计算;根据达西定律得到单层衬砌渗水量以及初期支护、防水层、二次衬砌背后水头,根据容重计算分别得到各自的孔隙水压力,外水压力折减系数,根据渗水量计算突水系数。本发明阐明了单层防水衬砌结构在水压下的力学性能,能够准确得知富水地层单层衬砌背后水压大小,为单层衬砌结构安全设计提供参考,减少隧道渗漏和受水压破坏的风险。