本发明属于大数据信息处理及智能化运维技术领域,提供了一种软件系统多指标异常检测方法及系统,其技术方案为:基于软件系统收集多维监控指标数据;然后利用注意力机制通过注意力权重来充分捕获多维监控指标数据的时间特征信息;使用图注意力网络来学习多维监控指标数据的空间特征信息;将学习到的时间特征信息和空间特征信息进行融合,构建基于变分Transformer的重构模型,经过残差变分自编码器得到隐变量,使用解码器得到最终的重构数据表示;基于重构数据与原始数据的重构损失来进行异常检测任务,解决了现有技术未充分考虑时间特征信息和空间特征信息,导致异常检测性能不佳的问题。