本发明涉及相机对焦技术领域,尤其涉及一种高光谱相机的自动对焦方法、系统、介质及设备。高光谱相机的自动对焦方法,包括:S1、获取相对被观测物体不同距离位置的多张图像,求取其中清晰度最高的图像;S2、以所述清晰度最高的图像对应的位置为基准,获取靠近所述被观测物体方向的多个位置的图像,以及远离所述被观测物体方向的多个位置的图像;S3、求取步骤S1中清晰度最高的图像和步骤S2中获取的所有图像中每个图像的平均信号强度,其中平均信号强度最强的图像对应的位置作为对焦位置。通过本发明的高光谱相机的自动对焦方法解决了人工对焦无法准确采集到信号最强的高光谱图像的问题,提高了对焦效率。